como hago para que los enlaces funcionen y los archivos se descarguen. los subi al servidor  clasificados por carpetas por que estan por tematica.

la direccion de mi pagina es: http://profesorberroa.webcindario.com

los archivos clasificados por tematica estan en: http://hosting.miarroba.com/webftp.php

Los tienes así <a href="%3Ca%20href=ftp.webcindario.com/perfil%3EEnlace%3C/a%3E">PERFIL</a> y deben ser así

<a href="http://profesorberroa.webcindario.com">Perfil</a> si esta en una carpeta , por ejemplo clases y archivo es clase1.doc sería <a href="https://profesorberroa.webcindario.com/clases/clase1.doc">Clase 1</a>

gracias por la intencion de ayudarme, pero aun los enlaces no me funcionan cambie los codigos como sugeriste pero aun no enlazan con los archivos

Fíjate si el href de los links repeta las mayúsculas/minúsculas del path y archivos (lo ideal es trabajar todo en minúsculas) y que los nombres de archivo también estén así.